学院共有2个学科：生物医学工程和电子信息。学院在已有优势的基础上形成了智能医学诊疗技术与器械、生物材料与组织工程、生物医学信息工程三个二级学科方向，涵盖了生物医学工程和电子信息学科的主要分支。目前，学院拥有光声智能影像与诊疗一体化、肝脏健康与智能诊疗2个校级平台。生物医学工程学科是重庆市“十三五”一流学科和重庆市“十四五”重点学科，电子信息学科是重庆市高等学校“十四五”市级重点学科。